Formado no Jacuipense e também com passagem pela base do Bahia, Matheus Bahia foi promovido ao time profissional em 2020. O lateral, que viveu bons e maus momentos pelo clube, chegou a despertar interesse de equipes da Europa, como o Porto, em 2021.
Em 2023, o lateral-esquerdo, de 24 anos, perdeu espaço entre os titulares. O jogador fez 28 jogos e deu uma assistência. Em 2024, com o Ceará, o jovem terá pela frente um calendário de disputas no Campeonato Cearense, Copa do Nordeste, Copa do Brasil e Série B do Campeonato Brasileiro.